Početkom 14. veka pripadnici krstaškog reda Tevtonski vitezovi pobili su većinu slovenskog stanovništva Gdanjska i okupirali tu oblast.

Drugi svetski rat započeo je baš u Gdanjsku 1. septembra 1939. godine. Sa nemačkog broda "Šlezing Holštajn" tog 1. septembra, u 4 sata i 40 minuta ispaljene su granate na vojni garnizon na poluostrvu Vesterplate i taj napad označio je početak Drugog svetskog rata.

Osamdesetih godina prošlog veka Gdanjsk se ponovo našao u centru pažnje evropske javnosti. U brodogradilištu "Lenjin" osnovan je prvi nezavisni i slobodni sindikat u Poljskoj. Zvao se "Solidarnost", a predvodio ga je električar Leh Valensa. Taj sindikat je vrlo brzo prerastao u pokret koji je okupio oko 10 miliona ljudi koji su nakon višemesečnih protesta uspeli da sruše komunistički režim u Poljskoj. Nakon toga usledili su prvi slobodni izbori na kojima je Leh Valensa izabran za predsednika Poljske.

Gdanjsk je vekovima bio svetska prestonica ćilibara. Od tog grada ka zemljama južne Evrope vodio je tzv. ćilibarski put. To "zlato severa" kako su ga mnogi nazivali talasi su izbacivali na obale Baltičkog mora, a trgovci su ga posebno cenili jer je smatran najfinijim ćilibarom na svetu.

Gdanjsk je i grad u kome se nalazi najveća crkva na svetu sazidana od cigle. To je bazilika Svete Marije čija je gradnja započeta u 14. stoleću i trajala gotovo čitav vek. Taj hram je dug 106 metara i u njega može da stane 25.000 ljudi.