U ovom nastavku Nindža kornjače: Donatelo, Mikelanđelo, Leonardo i Rafaelo, koji su ljudske veličine i savršeno poznaju borilačke veštine, sa svojim mentorom Splinterom, kao mudrim velikim pacovom, sele se iz kanalizacije u stan svoje saveznice i novinarke Ejpril.

U međuvremenu se Šreder, zli vođa zloglasnog "Foot" klana, za koga su kornjače mislile da je mrtav, odjednom pojavljuje i ujedinjuje snage koje žude za osvetom.

U ovom nastavku kornjače saznaju kako su postale mutirane nindže koje hodaju, pričaju i karateom savladavaju zle i pokvarene. Ali, pre nego otkriju istinu, pretiče ih zli Šreder koji ima svoje planove. Nindže će još jednom morati da spašavaju svet.

Uloge: Pejdž Turko, Dejvid Vorner, Erni Rejes...

Režija: Majkl Presmen